Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Speer4f1Q9D5Q6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Speer4f1Q9D5Q6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Speer4f1Q9D5Q6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms