Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930513O06RikQ9D549 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930513O06RikQ9D549 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930513O06RikQ9D549 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930513O06RikQ9D549 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930513O06RikQ9D549 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930513O06RikQ9D549 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930513O06RikQ9D549 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930513O06RikQ9D549 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.6 ms