Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zcchc13Q9D548 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Zcchc13Q9D548 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Zcchc13Q9D548 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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