Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D4W2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D4W2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D4W2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D4W2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D4W2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D4W2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D4W2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D4W2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D4W2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D4W2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D4W2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms