Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp4Q9D4F8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubgcp4Q9D4F8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms