Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4933402E13RikQ9D4D2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933402E13RikQ9D4D2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms