Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrp2bpQ9D4C6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrp2bpQ9D4C6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrp2bpQ9D4C6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms