Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krtap5-3Q9D226 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krtap5-3Q9D226 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krtap5-3Q9D226 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krtap5-3Q9D226 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms