Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nol3Q9D1X0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nol3Q9D1X0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nol3Q9D1X0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms