Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chordc1Q9D1P4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chordc1Q9D1P4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms