Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MrnipQ9D1F5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MrnipQ9D1F5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms