Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan11Q9D1D1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan11Q9D1D1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan11Q9D1D1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms