Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx56Q9D0R4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx56Q9D0R4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx56Q9D0R4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms