Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdca7Q9D0M2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdca7Q9D0M2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdca7Q9D0M2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdca7Q9D0M2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms