Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ6

Rex1bd, Required for excision 1-B domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rex1bdQ9CYZ6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rex1bdQ9CYZ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rex1bdQ9CYZ6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rex1bdQ9CYZ6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rex1bdQ9CYZ6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rex1bdQ9CYZ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rex1bdQ9CYZ6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rex1bdQ9CYZ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms