Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms