Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc96Q9CR92 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc96Q9CR92 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms