Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45gip1Q9CR59 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gadd45gip1Q9CR59 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45gip1Q9CR59 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms