Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2Q9CQP2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc2Q9CQP2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc2Q9CQP2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms