Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Snrpb2Q9CQI7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpb2Q9CQI7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpb2Q9CQI7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms