Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Atp6v0e1Q9CQD8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Atp6v0e1Q9CQD8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Atp6v0e1Q9CQD8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Atp6v0e1Q9CQD8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Atp6v0e1Q9CQD8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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