Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms