Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rrbp1Q99PL5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rrbp1Q99PL5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rrbp1Q99PL5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1120.1 ms