Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim3Q99PE5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms