Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2ird2Q99NI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms