Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pcgf6Q99NA9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pcgf6Q99NA9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pcgf6Q99NA9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms