Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q99M08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q99M08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q99M08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q99M08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q99M08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q99M08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q99M08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q99M08 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q99M08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q99M08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q99M08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q99M08 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q99M08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q99M08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q99M08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q99M08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q99M08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q99M08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q99M08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q99M08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q99M08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q99M08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q99M08 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q99M08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q99M08 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q99M08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q99M08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q99M08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q99M08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99M08 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99M08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99M08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q99M08 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q99M08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99M08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99M08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99M08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99M08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99M08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99M08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99M08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99M08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q99M08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99M08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99M08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99M08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99M08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99M08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99M08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99M08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99M08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99M08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms