Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gins4Q99LZ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gins4Q99LZ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gins4Q99LZ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms