Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TriobpQ99KW3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TriobpQ99KW3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms