Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf34Q99KR6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf34Q99KR6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms