Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cts3Q91ZD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cts3Q91ZD5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cts3Q91ZD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cts3Q91ZD5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cts3Q91ZD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cts3Q91ZD5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cts3Q91ZD5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cts3Q91ZD5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cts3Q91ZD5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cts3Q91ZD5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms