Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc1Q91Z38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc1Q91Z38 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc1Q91Z38 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms