Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrp1bQ91YK2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms