Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha7Q91Y13 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha7Q91Y13 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha7Q91Y13 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms