Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nsmce2Q91VT1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsmce2Q91VT1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.1 ms