Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ApobrQ8VBT6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ApobrQ8VBT6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ApobrQ8VBT6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ApobrQ8VBT6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms