Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shtn1Q8K2Q9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shtn1Q8K2Q9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms