Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ClasrpQ8CFC7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClasrpQ8CFC7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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