Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc159Q8C963 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc159Q8C963 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc159Q8C963 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc159Q8C963 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc159Q8C963 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms