Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dclre1bQ8C7W7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dclre1bQ8C7W7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dclre1bQ8C7W7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms