Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubqln3Q8C5U9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Ubqln3Q8C5U9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Ubqln3Q8C5U9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Ubqln3Q8C5U9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubqln3Q8C5U9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Ubqln3Q8C5U9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubqln3Q8C5U9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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