Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933409G03RikQ8C5U0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933409G03RikQ8C5U0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms