Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim35Q8C006 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim35Q8C006 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim35Q8C006 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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