Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssc5dQ8BV57 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ssc5dQ8BV57 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ssc5dQ8BV57 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ssc5dQ8BV57 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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