Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
E330017A01RikQ8BU47 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E330017A01RikQ8BU47 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330017A01RikQ8BU47 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms