Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spock3Q8BKV0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock3Q8BKV0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms