Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK1

Nipa1, Magnesium transporter NIPA1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipa1Q8BHK1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nipa1Q8BHK1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipa1Q8BHK1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipa1Q8BHK1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nipa1Q8BHK1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nipa1Q8BHK1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nipa1Q8BHK1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nipa1Q8BHK1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms