Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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