Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srgap3Q812A2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Srgap3Q812A2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srgap3Q812A2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms