Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY6

Celf4, CUGBP Elav-like family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf4Q7TSY6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Celf4Q7TSY6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Celf4Q7TSY6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Celf4Q7TSY6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms